Ang liham ni Pablo kay Filemon ay tumatalakay sa sitwasyon ni Onesimo, isang tumakas na alipin na naging Kristiyano. Ipinapahayag ni Pablo na ang pansamantalang paghihiwalay ni Onesimo kay Filemon ay maaaring bahagi ng isang banal na plano, na nagbibigay-daan para sa mas malalim at walang hanggan na relasyon sa kanyang pagbabalik. Ang pananaw na ito ay nag-uudyok sa mga mananampalataya na isaalang-alang kung paano maaaring kumilos ang Diyos sa mga hamon at paghihiwalay sa buhay upang magdulot ng paglago at pagkakasundo.
Ang mensahe ay nagbibigay-diin sa mapanlikhang kapangyarihan ng pag-ibig at pagpapatawad sa Kristiyanismo. Si Onesimo ay hindi na lamang isang alipin kundi isang kapatid sa pananampalataya, na nagpapakita ng radikal na pagkakapantay-pantay at pagkakaisa na dala ng Ebanghelyo. Inaanyayahan ni Pablo si Filemon na tanggapin si Onesimo sa kanyang pagbabalik, hindi dahil sa obligasyon, kundi dahil sa pag-ibig, na sumasalamin sa bagong pagkakakilanlan na kanilang ibinabahagi kay Cristo. Ang talatang ito ay nag-uudyok sa mga Kristiyano na yakapin ang pagpapatawad at tingnan ang iba sa pamamagitan ng lente ng biyaya ng Diyos, na nagtataguyod ng mga ugnayang hindi lamang naibalik kundi pinalalim pa ng sama-samang pananampalataya.