W konstrukcji przybytku przebłagalnia, czyli miejsce miłosierdzia, umieszczona jest na arce przymierza w Najświętszym Miejscu. To miejsce jest najgłębszą częścią przybytku, symbolizującą bliską obecność Boga wśród Jego ludu. Przebłagalnia jest znacząca, ponieważ reprezentuje Boży tron na ziemi, gdzie raz w roku arcykapłan spotykał się z Bogiem w Dzień Przebłagania, aby przebaczyć grzechy Izraela. Ten akt podkreśla tematy świętości, czci i boskiego miłosierdzia.
Arka zawiera tablice z prawem przymierza, które są świadectwem Bożych obietnic i oczekiwań wobec Jego ludu. Umieszczając przebłagalnię na arce, ilustruje to, jak Boże miłosierdzie przykrywa prawo, oferując przebaczenie i pojednanie. Ta symbolika jest potężna, przypominając wierzącym o znaczeniu zbliżania się do Boga z szacunkiem i wdzięcznością za Jego łaskę. Dodatkowo, zapowiada ostateczne przebłaganie dokonane przez Jezusa Chrystusa, który otwiera drogę dla wszystkich, aby mogli z pewnością wejść w obecność Boga i otrzymać Jego miłosierdzie.
